Если я купила билеты на Сейшелы Катаром, получила разрешение на весь срок, но отдыхая там решила навестить Маврикий ( туда-обратно).

У нас был почти аналогичный кейс – полет катарами на Маэ из Москвы RT, в середине билеты Маэ-Мадагаскар-Маэ другой авиакомпанией (Emirates)

Вы оформляете разрешение №1 на срок когда вы влетаете на Сейшелы и до дня вылета на Маврикий, в качестве обратного билета подкрепляете билет Маэ-Маврикий

И второе разрешение уже на влет с Маврикия на Маэ, а в качестве обратного билет в РФ

Возможно, в первом разрешении надо указывать билет на Маврикий. Т.е. дату первого выезда с Сейшел. Но не в Москву , а на маврикий