У сына 14 лет паспорт РФ и МД. Если ехать к бабушке в МД, есть разница, по какому въезжать?

Сказали, что лучше сейчас вообще не показываться там, что не выпускают, если не встал на учёт в военкомате. Это правда, что мальчикам там нужно вставать на учет? Если он въедет по паспорту РФ, всё равно по биометрии пробьют?