Недавно открыли компанию и нужно об этом теперь уведомить налоговую в РФ.

Да нужно отчётность в ФНС вести.

Берёте Trade license, Memorandum переводите их на русский язык и заверяете у нотариуса. Насчёт легализации документов в ОАЭ в вашем случае честно говоря точно не могу сказать

В ОАЭ летать для легализации не надо сейчас всё делают онлайн. Назначаете встречу с нотариусом, производите оплату, выходите на видео звонок (если не знаете английском то ещё за переводчика платите 500 дирхам) и уже на встрече ранее подготовленные документы вам нотариус заверит

В ФНС подаётся:

уведомление об участии;

при необходимости — отчёт о КИК.

Если вы открыли тут компанию и с рф никак она не связана. Филиалы там всякие и тд

Если вы об "уведомлении об участии в иностранных организациях (об учреждении иностранных структур без образования юридического лица)", то там ничего не нужно - просто заполняете форму в личном кабинете в налоговой и всё. Никакие уставы и лицензии им не нужны, это же декларативная форма. Когда вы будете отчитываться о прибыли КИК, там есть нюансы, обычно требуют перевод бухотчётности / аудиторского заключения. Я их подавал просто переведя PDF в гугле.