Подскажите, ничего страшного, если для подтверждения занятости на визу Италии указать самозанятость, которая существует у меня только в течение двух месяцев?

По найму у вас отразится в ЭТК, не придется указать. Добавить самозанятость тоже можно. Я так делала в прошлом году

Ваша официальная работа отражается в ЭТК, которую вы будете подавать. Поэтому вам нужно подаваться как работающей в найме (уровень зп не важен). Самозанятость в этом случае показывать не нужно.