Подскажите, каким образом можно добраться из Ташкента в Бухару и из Бухары в Самарканд? Самолеты дорого, а больше что-то нет никаких альтернативных вариантов.

Можно обычным поездом, не афросиабом. Дольше, но билеты проще достать Лучше, кстати, наоборот, Ташкент-Самарканд-Бухара. Потому что всё равно, чтоб в Бухару попасть, Самарканд проезжать будете