Есть теудат зеут, но нет даркона, лечу в Израиль из России по российскому загранпаспорту, как проходить таможню в Тель-Авиве? Как турист или как гражданин Израиля?

Если гражданство совсем свежее - можно по российскому, а если нет - правильно в консульстве получить новый паспорт.

вроде так было

Как турист вы больше не въезжаете в Израиль.

На въезде даёте тз и паспорт какой есть, и говорите - пустите, паспорта нет т.к.

Да, и может быть есть смысл сделать eta il

Не парьтесь. Просто идете не там где проходят граждане, а правее к пограничнику. И показываете ему ТЗ (на самом деле достаточно назвать свой ID) и Вас пропустят как гражданина. У меня сын так летал много раз. Тем более, до конца этого года можно летать по паспорту страны исхода.