Подскажите, пожалуйста, можно ли из Турции прилететь на отдых на три дня на Северный Кипр гражданину РФ имея турецкий ВНЖ?

Технически - можно.

Фактически - для Республики Кипр это незаконно.

Прилететь и оставаться на северной части, не пытаясь проехать на южную - без проблем. Проблемы возникнут при оформлении в дальнейшем визы Кипра. Я не знаю, ставят ли сейчас по прибытии в Эрджан штамп в паспорт или на отдельный листок, но если в паспорт - это отказ 100%, если на отдельный листок, то на кипрской стороне прекрасно осведомлены о таком варианте, поэтому, если они видят, что Вы, к примеру вылетели из Турции 5 сентября, вернулись назад 9 сентября (турецкие штампы по-любому поставят), и нет никаких промежуточных штампов, то эта ситуация, как правило, будет приравнена к первой с соответствующими для Вас последствиями.