Получил визу типа Д в Словакию, в графе platí pre указана только Словацкая республика. Не будет проблем, если я прилечу через Будапешт?

platí pre указана только Словацкая республика - потому что ваше долгосрочное пребывание разрешено только в Словакии, тут все верно, но это вас не ограничивает по перемещению внутри шенгена.

Знакомые из Белграда с Испанскими визами Д ехали на машине через Венгрию (первый въезд был) - проблем не было пустили

Другие самолетов в Вену (также первый въезд) - тоже проблем не было