Подскажите, пожалуйста, если летишь на отдых во Вьетнам, а оттуда на пару дней в Камбоджу/Сингапур, всё-таки ставят повторную визу на 45 дней в росс.паспорт при возвращении или нужно мультивизу оформлять?

Нету визы на 45 дней, это просто штамп.

Да, его ставят при каждом пересечении границы для граждан РФ

Учитывайте тот факт что если у вас нет визы в Сингапур, то транзит там работает только с учетом перелета в 3ю страну, т.е. вы не сможете полететь: Вьетнам-Сингапур-Вьетнам