Подскажите, кто летал москва -стамбул-гавана на Turkish airlines: нужно ли проходить какие-то дополнительные длительные досмотры в Стамбуле при трансфере?

Это зависит от оформления билетов - стыковочный рейс или пересадочный. Если у вас нет багажа то даже при пересадочном рейсе вы можете в Стамбуле использовать зону трансфера (там указатели). При наличии багажа нужно будет его получить и пройти контроль. По опыту Стамбул Мексика они оформляли как пересадочный - багаж надо было получать и повторно сдавать.