Подскажите пожалуйста как происходит процедура покупки багажа в Мале до Москвы (аэрофлот)?

На стойке регистрации!

Регистрируетесь на рейс, там же оформляете багаж и вас отправляют оплачивать его. Повторно в очереди стоять не надо. Просто подойдете к стойке регистрации за своими посадочными.

Оплата доллары налом или карта (российские не принимают).