Друзья! научите как правильно мне - россиянину, имеющему второе гражданство -паспорт Киргизии, поехать на авто в Европу?

А зачем вам российский паспорт если у вас есть киргизский, с ним и езжайте

страна регистрации авто к ВУ мало отношения имеет, если вы постоянно не проживаете в ЕС, то можете показывать любое ВУ, которое там принимается.

Соответственно мы использовали РФ ВУ (причем с не РФ паспортами) пока разрешало эстонское законодательство (после регистрации места жительства в Эстонии нужно заменить ВУ на эстонские в течение года, но не раньше чем через 6 мес).