Вот такой вопрос: ETA в Кению до 20 апреля, но на штампе при въезде стоит 3М (3 месяца) при этом, 3 месяца истекает 5 мая. До 20 апреля необходимо покинуть страну или до 5 мая?

Вам с визой в паспорте еТА уже никакой роли не играет, ориентируйтесь на визу, если Вы уже в стране.

До 5 мая как в визе. еТа - это разрешение на въезд и ограничивает сроки въезда. Виза - это разрешение на пребывание и ограничивает сроки пребывания.