Если я подавала документы на визу Италии в Альмавиве в Краснодаре , а улетаю из Москвы. Могу забрать паспорт в Москве?

Да, но нужно заранее это согласовать. Нужно будет 1000 дополнительно заплатить

Связывайтесь с визовым центром. Они там за такое просят 1000р, но делают.