Ситуация такая: я отец живу в Израиле, у моей жены есть тоже гражданство, но она с нашими 2мя детьми 4ками живёт в России последние полтора года, визы А 5 естесственно просрочены.

Визы продлили тогда. Вообще не будет однозначного ответа "продлят", " не продлят". Все это настолько рандомно..

Не понятно, жена приедет жить с детьми вместе или только дети? Если только дети, то с женой придется развестись, если все вместе, то важен возраст детей, чем младше, тем проще, но главное до 18 лет. Если все вместе и дети до 18, то пустят и с вероятностью 90% визы восстановят, но нервы помотают и время займет. Еще медстраховку надо будет восстанавливать. По порядку действий, по приезду записаться в школу, потом идти в мвд с документами об аренде, справками из школы и тп по списку вашего мвд, он разный у всех.