Можно ли в Москве получить внутренний паспорт? Есть старый паспорт который получил в 16 лет, после не менял

Нет. Только заграничный паспорт

Внутренний на то он внутренний что действует только на территории страны и получить его можно только в самом Таджикистане

Нет. Консульства за границей не выдают внутренние паспорта. Заграничный могут.