Скажите каким транзитом лучше доехать из Москвы до Мекки

Нет абсолютно никакой разницы, смотрите на цену перелета и время в пути.

У тур операторов иногда бывают и прямые рейсы.

Москва - Джидда

В Мекке аэропорта нет, ближайший аэропорт в городе Джидда

Вам до Кувейта долетит и оттуда до Джидды.

Дальше до Мекка как хотите, или автобус или такси