Скажите, пожалуйста, а если просрочен российский паспорт, надо лететь в Россию, можно билеты брать на даркон в Израиле?

Конечно можно

Билеты берите хоть на паспорт Зимбабве, не имеет никакого значения. А вот границу РФ придеться проходить по просроченному, возможно придеться заплатить небольшой штраф при этом. А для вылета нужно будет получить новый паспорт, по просроченному точно не выпустят. За деньги сделают его достаточно быстро, по стандарту до 3-х месяцев.