Я гражданка Молдовы, жду российский паспорт,после получения паспорта РФ, надо ли мне подать уведомление что у меня два паспорта ,и где? И за какой срок?

Посмотрите на гос услугах

Но вылетать строго по загран паспорту Росиии

В РФ уведомления подавать не надо, они знают про молдавский. Если не указали другие, например, румынский, то надо. Но про румынский Вы должны были сообщать при подаче на гражданство.

В Молдове обязанности сообщать о других гражданствах нет.

Нужно обязательно уведомлять в РФ миграционную службу после получения гражданства РФ о наличии также второго гражданства