На руках паспорт РФ и теудат маавар. Маршрут Россия - Шанхай - Япония. С остановкой в Шанхае на 3 дня. Как лучше покупать билеты? РФ-Китай-РФ на российский паспорт. А Китай-Япония-Китай - израильский?

билеты на любой, пересекать границы на выбор

Абсолютно не важно на какой паспорт вы покупаете билеты. Вы их покупаете у авиакомпаний. Главное, чтобы в обоих паспортах совпадали ваши имя и фамилия на латинице.

В России при посадке на борт в Китай у вас будут спрашивать основание для посадки. Т.к. у вас Шанхай 3 дня, видимо вы планируете транзит, для выполнения условий транзита вам придется продемонстрировать паспорт израиля для безвиза с японией. Сейчас на рейсы до китая из россии даже онлайн регистрации нет, потому что много косяков было с условиями въезда и приходилось авиакомпании везти обратно :) С русским паспортом на рейс до пекина пришлось показывать билет пекин-сеул и ETA в корею. Мужу тоже недавно пришлось во время регистрации покупать билет на вылет из пекина, чтобы соблюсти условия транзита (вылет в третью страну). При мне тоже такие ситуации случались. Многие хотят попасть в шанхай или гуанджоу, но транзит дают только с вылетом в третью страну из города транзита если 144 часа и мультистоп на 24 часа вроде как со сменой города (но мультистоп не пробовала). Попытка вылета из города другого региона приводит к возвращению в город прилета (пекин) и штрафу в полторы тыщи юаней за нарушение миграционных правил.