Скажите пожалуйста кто знает если российский загран просрочен в Литве выпустят обратно через кордон или что будет?

Выпустят, в РФ впустят, но со штрафом. Возьмите справку о возвращении в консульстве РФ. Съэкономите себе время на пограничном контроле.