Лечу в Россию с Италии. До Еревана укр. загран ( пермессо на украинские документы) , с Еревана до России ( имеются оба российских паспорта).

На погранконтроле вы ж не показываете билет, по которому прилетели, какая вам разница, на какой паспорт он взят.

На регистрации на рейс на вылете из РФ, естественно, придется показать сотрудникам авиакомпании и российский, и украинский паспорта плюс пермессо, иначе на рейс не посадят.