Подскажите плиз как лучше поступить. Планируется поездка по маршруту Вена ( 2 дня) - Прага ( 4 дня) - Будапешт ( 3 дня).

ваш маршрут по описанию венгерское консульство не примет

венгрия должна быть основной страной маршрута, а у вас - чехия

По первому варианту Вам в Чехию надо, а она не дает. Так что только по 2-му.

Отмена отелей не вариант. Звонил на днях в консульство в Екб, мне четко и жестко сказали, что отслеживают проживание согласно поданным докам на визу, т.е. видимо отели сливают инфу в консульство и обмануть не получится. Отмена проживания станет известной. Может в вашем случае стоит добавить день в Будапеште, но выехать на день раньше, в этом случае, это несущественный момент и вопросов лишних не будет. Цена оплаты за один день надеюсь не критична?