Подскажите пожалуйста, если в чемодане будет новый айфон запакованный, при перелете в египет налог не нужно будет платить или никто вообще не обратит внимания что он в чемодане?

Не будет проблем никаких, везите спокойно

Если не ошибаюсь, в багаж его нельзя

У нас не возникло проблем, был в ручной клади

Нельзя в багаже перевозить устройства с литий-ионными батареями, могут при проверке конфисковать. Возьмите в ручную кладь. Но будьте готовы, что могут потребовать открыть коробку и включить телефон. Таковы правила.