Подскажите пожалуйста, Aegean Airlines не берет дополнительной платы за регистрацию в аэропорту Ларнаки?

Не берет. Они не используют лоукостеровскую практику. У них self service компьютеры в аэропорту, вы можете самостоятельно зарегистрироваться онлайн и получить напечатанный посадочный талон.