Лечу Мин воды-Ереван. Ереван -Кишинёв. По прилёту в Ереван прохожу контроль по РФ паспорту! Ереван -Кишинёв какой паспорт предъявлять РФ или МД?

В Армении пограничникам любой, представителю авиакомпании везущей Ереван-Кишинев тот, на который выписан билет, в Молдове молдавский

А у вас не единый билет? В этом случае в Ереване не будет контроля вообще

Тот , по которому будете въезжать в Армению.. въезд и выезд по одному и тому же паспорту.. покажете пр въезде МД, то при выезде тоже МД, если рус, то и при выезде рус.. в Молдове МД

Даже лучше по прилету в Ереван Молдавский. Иначе, когда вылетать будете они спросят как влетели