Смотрю нячанг с вылетом из Москвы: перелёт с пересадкой в Алматы , и есть перелет с пересадкой в Гуанчжоу в Китае.

Гражданам РФ, при пересадке до 144 часов в Китае, ничего офрмлять не нужно. Из-за чего может быть разница в ценах, не подскажу. Их устанавливает авиакомпания.

Разница в цене только из-за перелета, у китайцев дешевле перелет

Берите с пересадкой в Китае, если дешевле. 1 остановка, виза в данном случае не нужна. Даже если рейс по каким-то причинам перенесут, китайцы вас сами пересадят, ещё и гостиницу с едой предоставят, в случае необходимости.