Может кто то сталкивался с таким, если влететь во Вьетнам по одному паспорту а вылетать по другому, будут ли проблемы на паспортном контроле???

Не знаю насчёт Вьетнама, но я так в Казахстан летала и мне ничего не сделали)

Я по земле въезжала во Вьетнам из Камбоджи, искали штамп камбоджи. Пропустили когда показала его в другом паспорте. В общем, если решите так делать, второй лучше бы захватить. Но чисто технически потом в базе может сбоить и показывать что вы не вылетели при подаче на визу.