Работаю на Кипре. Подскажите, если мой сотрудник получил рабочую визу на 3 года.

Могут аннулировать очень легко, если он будет отсутствовать более 90 дней подряд на Кипре.

Нельзя покидать Кипр более чем на 90 дней подряд. С большой долей вероятности это может привести к отмене ВНЖ. Про это написано и на сайте мигрейшена и на Ресипте, который выдают при оплате во время подачи документов на ВНЖ.