Подскажите пожалуйста если я въехала в Молдавию по русскому паспорту, то выезжать надо тоже по нему? или по молдавскому ?

По какому хотите - молдованям все равно )

По любому.

Единственное : при следующем Посещении с рф паспортом , у вас обязательно потребуют мд паспорт, так как высветится просрочка ( 90 дней)

Алена, по российскому и выезжайте вы обязаны по нему и выехать, вам потом проблемы ни к чему!