С чего начать репатриацию внутри Израиля ? В какое министерство идти в первую очередь?

В мисрад апним (МВД)

Вам нужен визовый отдел мвд либо по месту жительства (если там есть этот отдел, они не в каждом мвд), либо ближайший к вам, открывать дело о смене статуса, подавать анкету, которую отправят в Натив.

Для начала въехать в Израил, при помощи натива в аэропорту Далее в визовый отдел МВД ( не во всех МВД есть визовый отдел ) открыть дело о репатриации , далее в Натив.