Такой вопрос: если я открываю внж через контракт с работодателем, но в течение года (до сдачи отпечатков) увольняюсь, открываю partita iva и работаю в таком формате, это может стать препятствием для получения внж?

По идее это разные мотивы для нулла оста и пермессо, а значит нулла оста нужно будет запрашивать заново. Лучше дождаться получения пермессо, и потом попробовать конвертировать (здесь не уверена, как будет выглядеть процесс)