Подскажите, пожалуйста! Супруга в конце марта улетает из Таиланда.

Штамп можно продлить только на 7 дней, турвизу после 60 дней можно продлить ещё на 30. Так что если у неё штамп по прилёту и нужен ещё месяц, то бордер без вариантов.

Если у нее штамп на 90 дней сейчас заканчивается, то нет конечно вам ничего не продлят в миграционке. Езжайте на бордер. Можете сейчас вылететь на дней 5, и вернуться опять по штампу.