Если виза 90 дней в таиланде будет кончаться позже 30.04.24, то остаток после этой даты будет считаться недействительным?

Не виза, штамп же. Это разные вещи.

Если вы получаете штамп 29 04. На 90 дней, все 90 дней будут действительны) Штамп будет на 3 мес. При условии что ставят 90 дн штамп.