Кто был на Мальдивах, подскажите, как выбраться с острова, если местный персонал, говорит , что не дают чужим лодкам суда подплывать?

Если просто прогуляться - то никак) на экскурсию, которую организует сам резорт только. По уважительной причине - к руководству резорта обратиться можно.

Только их транспортом, если не согласовать лодку штраф с лодки 500$.

Решайте через своего агента или ТО или dmc они все без проблем согласуют.