Можно ли гражданину России с двойным гражданством пересекать границу Казахстана внутренним паспортом России а потом Загранпаспортом Таджикистана лететь в Таджикистан?

Нет из России тока загранпаспорт.

Из РФ в Казахстан можно въехать по внутреннему паспорту.

Выезжая из страны надо показывать тотже паспорт на пограничном контроле что и при вьезде в страну. Представителям авиакомпании можно показывать тот паспорт который удобно.