Подскажите, пожалуйста, после поездки в Иран, будут проблемы со въездом в Европу?

Нет. Штамп в загране не ставится.

Да и вообще визит Ирана никак не отражается на др страны. У самиз иранцев часто двойное гражданство и паспорта Ирана , Америки, Канады и т. д. у нас только с Израилем проблемы в двустороннем порядке.