Подскажите, что на счёт если матери пришло одобрение на ВНЖ Литвы, а ребёнку нет пака, что могло бы это значить?

Ждать, только остаётся. Либо позвоните в миграцию там точно ответят. У знакомых так было, все хорошо в итоге, чуть позже пришло на ребёнка.