Можно ли въехать в Литву и выйти в Вильнюсе или Чечне на поезде Москва-Калининград гражданину РФ, имеющему испанский вид на жительство? Посадят ли на поезд и выпустят ли в Литве?

Только с РФ загран. паспортами, или РФ виза для вьезда.

Станция называется Кяна (Kena). Да, выпустят; подробная информация есть в закрепах чата (полистайте).

Посадят, и выпустят, но только в Литве. Чечня в другой стороне.