Подскажите про поезд через Кяну в Калининград - если у меня будет большой чемодан, я его могу поставить под сиденья ? Просто не помню там габариты.

Поместится чемодан, даже с огромными люди ездят) Ящиков же нет уже. Печать поставят, когда пограничники зайдут в поезд. Это при въезде в Литву.

По правилам ручная кладь не более 36 кг и габариты в сумме трёх измерений не превышают 180см. Так как Вы подсаживаетесь в Кена, а люди в поезде уже едут с Калиниграда, гарантий что будет место под Ваш большой чемодан, особенно если у Вас верхнее место, никаких. Как повезет.