У меня два Два паспорта, разные фамилии.. вылетаю с Внуково в Ереван.. покупаю билет на фамилию, что в паспорте РФ...

Зачем так усложнять или Вам нужен штамп в паспорте Украины , чтобы не было понятно что летите из РФ? В первом варианте билеты на самолёт покупаете по паспорту РФ и летние до Еревана по паспорту РФ а в Ереване через транзитную зону и на посадку в самолёт по паспорту Украины. В аэропорту Кишнева Вам поставят штамп о въезде на территорию МД . Если Вы хотите чтобы штамп получить в Ереване тогда покупаете отдельно билеты из РФ на паспорт РФ а из Еревана на паспорт Украины но так как одна из компаний из Еревана это флай уан а Вы летите с ручкой кладью а значит тариф стандарт то между пересадками от 9 часов и больше( к сожалению Флай уан двигает время как вперёд так и назад и надо быть гибким в плане готовности к вылету с запасом). Даже если Вы купите оба билета по второму варианту с Флай уан это не спасет Вас если они будут менять время вылета так как они это не учитывают . В первом варианте один билет в случае движения времени вылета компания учитывает что у Вас второй сегмент полёта. Если что-то не понятно можете меня набрать или задавать вопросы.