Мы только прилетели на Пхукет, живем на лагуне. Хотим на острова, скажите лучше тур брать или самостоятельно?

Смотря какие острова, на симиланы можно только туром, на пи-пи лучше самостоятельно и т. д.

Если ориентируетесь на местности и не дадите себя развести - то самим. Если впервые - то экскурсия.