Пожалуйста, подскажите, как лучше в Кишинев лететь, через Турцию или Ереван? И есть регистрация онлайн в Fly one, на сайте у них, правильно?

Через Ереван проще, т. к. аэропорт маленький и пересадки короткие, это лично мое мнение. Главное, брать единый билет, без прохождения погран контроля и сдачи багажа заново. За 24 часа открывается регистрация на сайте Flyone, нужно ее пройти и желательно распечатать посадочные талоны, все это будет расписано в билете, который придет на почту, внимательно все изучайте и читайте.

Ещё можно через Баку, там 2 раза в неделю хорошие стыковки найти можно.