А есть смысл отдельно бронировать отель и билеты на самолет на мальдивы? Или разница не столь велика ?

Разница не всегда есть, но за-то отдельно когда покупаешь билеты можно взять удобную стыковку или удобное время прилёта/вылета. А некоторые покупают билеты с длинной стыковкой удобной, чтобы выйти в город погулять (в Дубай, в Абу-Даби, в Дохе, в Манаме и т. д.)