Подскажите, пожалуйста: провела ровно 90 дней в стране ес( болгария) , но она не входит в шенгенскую зону.

Шенгенские страны дни пребывания считаются вместе, нешенгенские каждая раздельно. Т. е. можно следующие 90 пробыть или в Шенгене или в любой другой нешенгенской стране, в Болгарию в следующие 90 дней нельзя.