Кто-нибудь летал из Мск в Тель-Авив авиакомпанией Egyptair с пересадкой в Каире? Все нормально было? Там время стыковки 1 час 35 минут, есть ли риск опоздать на второй рейс, или все без проблем обычно?

Если у вас один билет из Москвы в ТА с пересадкой (а не два разных билета, когда надо заново регистрироваться в Каире), то даже если вы опоздаете на пересадку, вас будут обязаны посадить на следующий рейс. так что не переживал бы на эту тему.