Потеряла лист миграционной регистрации, а вылет в 5 утра, пропустят ли меня в аэропорту на вылет? Регистрация фиксируется в электронных базах?

Фиксируется если вы её фоткали - там есть QR.

Ничего страшного, все в базе есть у паспортного контроля.

Фиксируется, но вам нужно приехать заранее, переговорить с погранцами, объяснить ситуацию.