Подскажите пожалуйста какую комиссию берут индонезийские банки при снятии в банкоматах рупии с карты банков Казахстана?

Никакую. Комиссию за операцию берет банк-эмитент.

Личный опыт, снимал с каспи в BNI, комиссии не было, в пределах каспи лимита 300 000.