Подскажите, а если в Стамбул лететь сЛарнаки не Aegan, а двумя разными авиакомпаниями, но с пересадкой в Афинах, то виза нужна, верно я понимаю?

Нужна, потому что вам придется выходить для повторной регистрации Хотя, если сможете зарегистрироваться онлайн на второй рейс, тогда возможно и не нужна (но русских сейчас не регистрируют так обычно)