Подскажите, пожалуйста, на автостанции или жд вокзале в Вильнюсе есть камера хранения?

Есть.

На ж/д вокзале есть. Автоматические. Оплачивать монетками, в кассе разменивали.

Есть. Слева от входа. Мы взяли большую камеру и запихнули туда сразу 3 чемодана. Сначала надо её закрыть, потом оплатить и получите чек с кодом, который будете вводить потом. Стоит 4 евро.